Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm25452-201ENSMUST00000178776 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm23286-201ENSMUST00000178963 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm22640-201ENSMUST00000179035 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm25984-201ENSMUST00000179129 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm25585-201ENSMUST00000179469 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm26374-201ENSMUST00000179737 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm24040-201ENSMUST00000179786 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm25017-201ENSMUST00000179805 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm23618-201ENSMUST00000179912 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm26284-201ENSMUST00000180107 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm24570-201ENSMUST00000180314 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm24654-201ENSMUST00000180315 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm23817-201ENSMUST00000158449 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Trim71Q1PSW8 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202 ms