Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ttc39dQ0VF76 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ttc39dQ0VF76 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ttc39dQ0VF76 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ttc39dQ0VF76 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ttc39dQ0VF76 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ttc39dQ0VF76 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ttc39dQ0VF76 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ttc39dQ0VF76 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ttc39dQ0VF76 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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Ttc39dQ0VF76 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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Ttc39dQ0VF76 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ttc39dQ0VF76 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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