Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RxraP28700 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RxraP28700 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RxraP28700 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RxraP28700 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RxraP28700 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms