Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm14533-201ENSMUST00000117088 93 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Hoxd11P23813 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm22260-201ENSMUST00000178643 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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