Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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Ccl20O89093 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccl20O89093 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccl20O89093 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccl20O89093 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccl20O89093 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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Ccl20O89093 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccl20O89093 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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Ccl20O89093 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccl20O89093 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccl20O89093 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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Ccl20O89093 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccl20O89093 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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Ccl20O89093 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccl20O89093 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccl20O89093 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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Ccl20O89093 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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