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Protein–RNA interactions for Protein: O09165
Casq1, Calsequestrin-1, mouse
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405 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Casq1
O09165
Gm14001-201
ENSMUST00000118847
247 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Gm25184-201
ENSMUST00000157753
163 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Gm22087-201
ENSMUST00000158339
88 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Mir488-201
ENSMUST00000093595
109 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Traj30-201
ENSMUST00000103711
59 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Gm23012-201
ENSMUST00000104149
83 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Cr2-206
ENSMUST00000193801
206 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Olfr1483-ps1-201
ENSMUST00000208241
334 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Gm24887-201
ENSMUST00000104386
108 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Gm23314-201
ENSMUST00000157218
107 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Gm24132-201
ENSMUST00000104745
91 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Gm23987-201
ENSMUST00000117039
129 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Rab11fip4os2-202
ENSMUST00000132921
355 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Gm23783-201
ENSMUST00000157941
102 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Gm25834-201
ENSMUST00000158916
101 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Mir7038-201
ENSMUST00000184833
71 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
AC124687.1-201
ENSMUST00000221868
189 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Mir145a-201
ENSMUST00000083658
70 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
Casq1
O09165
Traj9-201
ENSMUST00000103731
58 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm22101-201
ENSMUST00000157928
103 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm22962-201
ENSMUST00000157962
73 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm25375-201
ENSMUST00000158157
135 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm27905-201
ENSMUST00000184005
207 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Mir7079-201
ENSMUST00000184697
69 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm24232-201
ENSMUST00000104314
132 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm11936-201
ENSMUST00000118323
160 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm25366-201
ENSMUST00000158845
124 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm42623-201
ENSMUST00000197225
379 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Mir1a-2-201
ENSMUST00000198520
72 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Mir6915-201
ENSMUST00000198839
69 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm23303-201
ENSMUST00000082714
152 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm25985-201
ENSMUST00000122677
107 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm23003-201
ENSMUST00000179948
107 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
AC125190.3-201
ENSMUST00000223224
121 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm27803-201
ENSMUST00000183763
119 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Mir7651-201
ENSMUST00000184154
64 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm38295-201
ENSMUST00000191951
151 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Traj38-201
ENSMUST00000103704
62 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm14838-201
ENSMUST00000118913
248 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm23994-201
ENSMUST00000158059
88 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm27579-201
ENSMUST00000158113
63 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm23036-201
ENSMUST00000157885
99 nt
BASIC
-0.78
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm26712-201
ENSMUST00000180813
217 nt
BASIC
-0.78
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm24524-201
ENSMUST00000082925
170 nt
BASIC
-0.78
□□□□□ -2.53
Casq1
O09165
Gm24225-201
ENSMUST00000158825
98 nt
BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Mir764-201
ENSMUST00000103259
108 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Gm23483-201
ENSMUST00000104179
108 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Gm23278-201
ENSMUST00000157911
143 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Mir21b-201
ENSMUST00000184317
108 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Gm43907-201
ENSMUST00000203128
117 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Gm25899-201
ENSMUST00000082672
141 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Gm24374-201
ENSMUST00000104394
106 nt
BASIC
-0.81
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Mir1298-201
ENSMUST00000116681
98 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Gm23253-201
ENSMUST00000157441
104 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Snord2-201
ENSMUST00000157899
69 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Gm26403-201
ENSMUST00000158500
105 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Traj61-201
ENSMUST00000165025
72 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Gm27285-201
ENSMUST00000183875
127 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Snord67-201
ENSMUST00000104033
111 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Gm22105-201
ENSMUST00000116734
116 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Gm11644-201
ENSMUST00000119735
150 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Gm17020-201
ENSMUST00000172274
274 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Gm25247-201
ENSMUST00000175475
90 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Gm24823-201
ENSMUST00000175092
91 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Gm25397-201
ENSMUST00000176951
92 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
Casq1
O09165
Gm22348-201
ENSMUST00000178674
79 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Mir21c-201
ENSMUST00000184910
78 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Snord80-202
ENSMUST00000199023
77 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm23749-201
ENSMUST00000104223
131 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm25055-201
ENSMUST00000157369
76 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm25885-201
ENSMUST00000157779
109 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Ighv15-1-201
ENSMUST00000194450
276 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm44922-201
ENSMUST00000206690
90 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm23445-201
ENSMUST00000082800
107 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Traj35-201
ENSMUST00000103706
65 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm22542-201
ENSMUST00000158166
95 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm22607-201
ENSMUST00000158291
105 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm26379-202
ENSMUST00000200225
132 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm24868-201
ENSMUST00000157265
136 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm24077-201
ENSMUST00000158183
136 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm25993-201
ENSMUST00000175391
80 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm25249-201
ENSMUST00000175471
78 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm6607-201
ENSMUST00000215035
328 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm12013-201
ENSMUST00000121971
155 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm23180-201
ENSMUST00000158686
125 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm17677-201
ENSMUST00000166746
351 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm25802-201
ENSMUST00000082639
77 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm25337-201
ENSMUST00000083723
104 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Mir487b-201
ENSMUST00000102265
82 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm22720-201
ENSMUST00000122710
87 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
Casq1
O09165
Gm24587-201
ENSMUST00000116697
89 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
Casq1
O09165
Gm23291-201
ENSMUST00000175611
78 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
Casq1
O09165
Gm26438-201
ENSMUST00000082593
107 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
Casq1
O09165
Gm21940-201
ENSMUST00000204940
2278 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
Casq1
O09165
Gm17528-201
ENSMUST00000171026
239 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
Casq1
O09165
Gm24508-201
ENSMUST00000180104
107 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
Casq1
O09165
Gm6020-201
ENSMUST00000092094
66 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
Casq1
O09165
Mir669f-201
ENSMUST00000103850
121 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
Casq1
O09165
Gm24648-201
ENSMUST00000157111
132 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
Casq1
O09165
Gm26133-201
ENSMUST00000157363
100 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
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