Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.37□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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