Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Zfp558E9Q1J0 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Zfp558E9Q1J0 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
Zfp558E9Q1J0 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Zfp558E9Q1J0 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Zfp558E9Q1J0 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Zfp558E9Q1J0 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Zfp558E9Q1J0 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Zfp558E9Q1J0 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Zfp558E9Q1J0 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
Zfp558E9Q1J0 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Zfp558E9Q1J0 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Zfp558E9Q1J0 Gm22489-201ENSMUST00000116813 62 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Zfp558E9Q1J0 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Zfp558E9Q1J0 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Zfp558E9Q1J0 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Zfp558E9Q1J0 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Zfp558E9Q1J0 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Zfp558E9Q1J0 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Zfp558E9Q1J0 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Zfp558E9Q1J0 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Zfp558E9Q1J0 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Zfp558E9Q1J0 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Zfp558E9Q1J0 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Zfp558E9Q1J0 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Zfp558E9Q1J0 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Zfp558E9Q1J0 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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