Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc170D3YXL0 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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Ccdc170D3YXL0 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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Ccdc170D3YXL0 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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Ccdc170D3YXL0 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc170D3YXL0 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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Ccdc170D3YXL0 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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