Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 Gm22879-201ENSMUST00000082895 74 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 Mir466f-1-201ENSMUST00000104779 94 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Prr29B1ARI9 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm22056-201ENSMUST00000083386 81 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm24372-201ENSMUST00000104400 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Prr29B1ARI9 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Prr29B1ARI9 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Prr29B1ARI9 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Prr29B1ARI9 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Prr29B1ARI9 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Prr29B1ARI9 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Prr29B1ARI9 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Prr29B1ARI9 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Prr29B1ARI9 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Prr29B1ARI9 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Prr29B1ARI9 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Prr29B1ARI9 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Prr29B1ARI9 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Prr29B1ARI9 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Prr29B1ARI9 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Prr29B1ARI9 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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