Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rnft1Q9DCN7 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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Rnft1Q9DCN7 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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Rnft1Q9DCN7 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rnft1Q9DCN7 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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Rnft1Q9DCN7 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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