Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm24674-201ENSMUST00000179194 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RpainQ9CWY9 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RpainQ9CWY9 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 556.7 ms