Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tdrd12Q9CWU0 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tdrd12Q9CWU0 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tdrd12Q9CWU0 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tdrd12Q9CWU0 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tdrd12Q9CWU0 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tdrd12Q9CWU0 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.8 ms