Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SrrtQ99MR6 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SrrtQ99MR6 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SrrtQ99MR6 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.4 ms