Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Apobec3Q99J72 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Apobec3Q99J72 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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