Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Efr3bQ6ZQ18 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Efr3bQ6ZQ18 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Efr3bQ6ZQ18 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Efr3bQ6ZQ18 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Efr3bQ6ZQ18 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Efr3bQ6ZQ18 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Efr3bQ6ZQ18 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Efr3bQ6ZQ18 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Efr3bQ6ZQ18 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Efr3bQ6ZQ18 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Efr3bQ6ZQ18 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Efr3bQ6ZQ18 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Efr3bQ6ZQ18 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.2 ms