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Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDF8
Rhox4f, MCG113261, mouse
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205 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Rhox4f
Q2MDF8
Gm22105-201
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116 nt
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-1.17
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Vmn1r-ps120-201
ENSMUST00000120288
377 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm22557-201
ENSMUST00000157804
102 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm23065-201
ENSMUST00000158236
130 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm26160-201
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63 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm27755-201
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132 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm22031-201
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BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm12924-201
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BASIC
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□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
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100 nt
BASIC
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□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
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-1.19
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
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-1.19
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm25055-201
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BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
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107 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm25993-201
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BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Vmn1r-ps23-201
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BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm37624-201
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219 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm6293-201
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195 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm22784-201
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132 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm24192-201
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BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm26398-201
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BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm29140-201
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BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm44149-201
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226 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
CT030166.3-201
ENSMUST00000223203
193 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
AC167019.1-201
ENSMUST00000227913
106 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Snord42a-201
ENSMUST00000082606
65 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Mir9-2-201
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72 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm25186-201
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108 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Mir489-201
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107 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm11936-201
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160 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm25015-201
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128 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm28008-201
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186 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm25337-201
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104 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Rhox4f
Q2MDF8
Gm26255-201
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BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
Gm38019-201
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BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
Gm23242-201
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
Gm25970-201
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
Snord2-201
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BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
Mir6336-201
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
Gm44687-201
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BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
Gm24199-201
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BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
Gm24393-201
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BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
Gm26287-201
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
mt-Tw-201
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BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
Gm25793-201
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BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
Gm25267-201
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
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Mir466f-1-201
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BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
Gm28376-201
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TSL 5
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
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BASIC
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Q2MDF8
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BASIC
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
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BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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675 nt
APPRIS ALT2
TSL 5
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
-1.28
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Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Rhox4f
Q2MDF8
Gm23831-201
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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BASIC
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Rhox4f
Q2MDF8
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Rhox4f
Q2MDF8
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Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
Rhox4f
Q2MDF8
Gm25007-201
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Rhox4f
Q2MDF8
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297 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
Rhox4f
Q2MDF8
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Rhox4f
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BASIC
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Rhox4f
Q2MDF8
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Rhox4f
Q2MDF8
Gm11042-201
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120 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
Rhox4f
Q2MDF8
Gm23900-201
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108 nt
BASIC
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Rhox4f
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BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
Rhox4f
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Rhox4f
Q2MDF8
Gm22013-201
ENSMUST00000158788
103 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
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