Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
Sh3bp1P55194 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sh3bp1P55194 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Sh3bp1P55194 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sh3bp1P55194 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sh3bp1P55194 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Sh3bp1P55194 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sh3bp1P55194 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sh3bp1P55194 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sh3bp1P55194 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sh3bp1P55194 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sh3bp1P55194 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sh3bp1P55194 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 320.6 ms