Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccl20O89093 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccl20O89093 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccl20O89093 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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