Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc170D3YXL0 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc170D3YXL0 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc170D3YXL0 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc170D3YXL0 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc170D3YXL0 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 292.2 ms