Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn8Q9Z260 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Cldn8Q9Z260 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Cldn8Q9Z260 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Cldn8Q9Z260 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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