Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc47Q9D024 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc47Q9D024 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc47Q9D024 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc47Q9D024 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc47Q9D024 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc47Q9D024 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc47Q9D024 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc47Q9D024 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc47Q9D024 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc47Q9D024 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc47Q9D024 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc47Q9D024 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc47Q9D024 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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