Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Pggt1bQ8BUY9 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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