Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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