Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm23573-201ENSMUST00000104408 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Gm22550-201ENSMUST00000179774 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Gm22060-201ENSMUST00000082558 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd11P23813 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 D3Ertd254e-201ENSMUST00000165956 6503 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm23787-201ENSMUST00000122538 73 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
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