Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
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Zfp558E9Q1J0 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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Zfp558E9Q1J0 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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Zfp558E9Q1J0 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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Zfp558E9Q1J0 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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Zfp558E9Q1J0 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Zfp558E9Q1J0 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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