Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Cldn12Q9ET43 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Cldn12Q9ET43 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Cldn12Q9ET43 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Cldn12Q9ET43 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Cldn12Q9ET43 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Cldn12Q9ET43 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Cldn12Q9ET43 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Cldn12Q9ET43 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Cldn12Q9ET43 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Cldn12Q9ET43 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Cldn12Q9ET43 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Cldn12Q9ET43 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Cldn12Q9ET43 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.5□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Cldn12Q9ET43 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Cldn12Q9ET43 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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