Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc3Q9D6Y1 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc3Q9D6Y1 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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