Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc47Q9D024 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc47Q9D024 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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