Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Apobec3Q99J72 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Apobec3Q99J72 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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