Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Pggt1bQ8BUY9 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Pggt1bQ8BUY9 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Pggt1bQ8BUY9 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Pggt1bQ8BUY9 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Pggt1bQ8BUY9 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Pggt1bQ8BUY9 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Pggt1bQ8BUY9 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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