Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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Ttf1Q62187 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ttf1Q62187 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ttf1Q62187 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ttf1Q62187 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ttf1Q62187 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ttf1Q62187 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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Ttf1Q62187 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ttf1Q62187 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ttf1Q62187 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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Ttf1Q62187 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ttf1Q62187 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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Ttf1Q62187 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ttf1Q62187 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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Ttf1Q62187 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ttf1Q62187 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ttf1Q62187 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ttf1Q62187 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ttf1Q62187 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ttf1Q62187 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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Ttf1Q62187 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ttf1Q62187 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ttf1Q62187 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ttf1Q62187 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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