Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ssbp4Q3U4B1 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ssbp4Q3U4B1 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ssbp4Q3U4B1 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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