Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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