Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Rpusd3Q14AI6 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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