Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sh3bp1P55194 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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