Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccl20O89093 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccl20O89093 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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