Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Gm2056J3QQ02 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Gm2056J3QQ02 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Gm2056J3QQ02 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Gm2056J3QQ02 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Gm2056J3QQ02 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Gm2056J3QQ02 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Gm2056J3QQ02 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Gm2056J3QQ02 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Gm2056J3QQ02 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Gm2056J3QQ02 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Gm2056J3QQ02 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.3 ms