Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Zfp558E9Q1J0 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.7 ms