Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rexo5D3YW29 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rexo5D3YW29 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rexo5D3YW29 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rexo5D3YW29 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rexo5D3YW29 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rexo5D3YW29 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rexo5D3YW29 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rexo5D3YW29 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.3 ms