Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Cldn8Q9Z260 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
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