Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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Rnft1Q9DCN7 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rnft1Q9DCN7 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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Rnft1Q9DCN7 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rnft1Q9DCN7 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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Rnft1Q9DCN7 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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Rnft1Q9DCN7 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rnft1Q9DCN7 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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Rnft1Q9DCN7 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rnft1Q9DCN7 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rnft1Q9DCN7 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rnft1Q9DCN7 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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