Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc47Q9D024 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc47Q9D024 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc47Q9D024 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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