Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RpainQ9CWY9 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RpainQ9CWY9 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RpainQ9CWY9 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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