Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Mrpl49Q9CQ40 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Mrpl49Q9CQ40 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Mrpl49Q9CQ40 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Mrpl49Q9CQ40 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Mrpl49Q9CQ40 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Mrpl49Q9CQ40 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Mrpl49Q9CQ40 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Mrpl49Q9CQ40 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Mrpl49Q9CQ40 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Mrpl49Q9CQ40 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.2 ms