Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm22301-201ENSMUST00000082656 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd11P23813 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm22746-201ENSMUST00000082494 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.3 ms