Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
Ccl20O89093 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccl20O89093 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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