Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.86□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.9□□□□□ -2.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.97□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.9 ms