Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Ccdc170D3YXL0 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc170D3YXL0 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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