Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cldn8Q9Z260 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Cldn8Q9Z260 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Cldn8Q9Z260 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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